<div dir="ltr"><div>Yes, I chose the action &quot;terminate&quot; to make the nan mask. But if Con2Prim of GRHydro finds NaN first, then the run is terminated before making the output of the nan mask.<br><br></div>Hee Il<br>
</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2014-04-29 18:35 GMT+09:00 Erik Schnetter <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:schnetter@cct.lsu.edu" target="_blank">schnetter@cct.lsu.edu</a>&gt;</span>:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hee Il<br>
<br>
Are you setting NaNChecker::action_if_found = &quot;terminate&quot;? If you set it to &quot;abort&quot;, then NaNChecker will abort before the nan mask can be output.<br>
<br>
-erik<br>
<div><div class="h5"><br>
On Apr 29, 2014, at 11:30 , Hee Il Kim &lt;<a href="mailto:heeilkim@gmail.com">heeilkim@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
<br>
&gt; Hi,<br>
&gt;<br>
&gt; I used to visualize the positions of NaNs simply by using contour plot of visit. But I failed to visualize the data of NaNmask.h5 generated by recent ET and GRHydro. The output says NaNChecker found NaNs and terminated the run. I tweaked the following parameters but got no difference:<br>

&gt;<br>
&gt; NaNChecker::ignore_restricted_points = &quot;no&quot;<br>
&gt;<br>
&gt; IOHDF5::output_symmetry_points = no<br>
&gt; IOHDF5::out3D_ghosts           = no<br>
&gt;<br>
&gt; I tested even the logging level dependency. The crash time depends on it but no difference for NaN visualization. Actually the above hdf5 setup makes very weird Carpet grids but might do only on Visit.<br>
&gt;<br>
&gt; I&#39;m using the latest version of stable ET. My visit has no problem in displaying NaNmask.h5 made by old ET.<br>
&gt;<br>
&gt; Thanks for your help in advance,<br>
&gt;<br>
&gt; Hee Il<br>
&gt;<br>
</div></div>&gt; _______________________________________________<br>
&gt; Users mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:Users@einsteintoolkit.org">Users@einsteintoolkit.org</a><br>
&gt; <a href="http://lists.einsteintoolkit.org/mailman/listinfo/users" target="_blank">http://lists.einsteintoolkit.org/mailman/listinfo/users</a><br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
--<br>
Erik Schnetter &lt;<a href="mailto:schnetter@cct.lsu.edu">schnetter@cct.lsu.edu</a>&gt;<br>
<a href="http://www.perimeterinstitute.ca/personal/eschnetter/" target="_blank">http://www.perimeterinstitute.ca/personal/eschnetter/</a><br>
<br>
My email is as private as my paper mail. I therefore support encrypting<br>
and signing email messages. Get my PGP key from <a href="http://pgp.mit.edu/" target="_blank">http://pgp.mit.edu/</a>.<br>
<br>
</font></span></blockquote></div><br></div>