<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none"><!-- P { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>Hello,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>This is a followup question regarding me using ET to do runs on the BigGreen cluster at Marshall University, WV.&nbsp;<br>
</p>
<p>I am compiling the executable with&nbsp;simfactory/mdb/optionlists/centos.cfg<br>
</p>
<p>This executable has the setting</p>
<p><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">CPP</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; font-variant-ligatures: no-common-ligatures; background-color: rgb(230, 230, 0);">FLAGS</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">=-DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK</span><br>
</p>
<p>and a lot of&nbsp;openmp flags commented out.&nbsp;<br>
</p>
<p>First I left these commented out and just give the mpich directory:</p>
<p><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">M</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">PI_DIR=</span>/opt/ohpc/pub/mpi/mpich-gnu7-ohpc/3.2.1</span></p>
<p><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">However, when looking at the config-info, I see that it compiled with mpich flag and openmpi:</span></p>
<p><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">CPP</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; font-variant-ligatures: no-common-ligatures; background-color: rgb(230, 230, 0);">FLAGS</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">=-DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK</span><br>
</span></span></p>
<p><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">HDF5_DIR=/opt/ohpc/pub/libs/gnu7/hdf5/1.10.1</span><br>
</span></p>
<p><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><br>
</span></span></p>
<p><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">Everything seems working, I just&nbsp;</span><span style="font-size: 12pt;">I want to make sure this won't cause problems when running the executable.&nbsp;</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;">It would be cleaner to&nbsp;compile with openmpi from the beginning. W</span><span style="font-size: 12pt;">ill you please let me know what flags to silence and what to turn on, in order to compile with openmpi?</span></p>
<p><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures"><br>
</span></p>
<p><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">thanks,</span></p>
<p><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures">Maria</span></p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
<div>
<div dir="ltr">_______________________</div>
<div dir="ltr"><font size="2"><i>Dr. Maria C. Babiuc Hamilton</i></font></div>
<div dir="ltr"><font size="2"><i>Department of Physics</i></font></div>
<div dir="ltr"><font size="2"><i>Marshall University</i></font></div>
<div dir="ltr"><font size="2"><i>S257 Science Building</i></font></div>
<div dir="ltr"><font size="2"><i>Huntington, WV, 25755</i></font></div>
<div dir="ltr"><font size="2"><i>Phone: (304)696-2754</i></font></div>
<div dir="ltr"><br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>