<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    <p><br>
    </p>
    <div class="moz-cite-prefix">On 3/8/2023 2:13 PM, Enzo Iubini wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CALW_x=7gcp1+h9RtwyZkaRc2iKr99htn3Yo0Lno1bYnXPCUq6Q@mail.gmail.com">
      <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=UTF-8">
      <div dir="ltr">Thank you Steve!
        <div><br>
        </div>
        <div>My problem is: the simulation gifs of the Wave Equation and
          Heat Equation notebooks on the tutorial folder are not showing
          correctly.</div>
      </div>
    </blockquote>
    <p>So I just clicked through the heat equation notebook. The cell
      that ends with:</p>
    <p>## play animation<br>
      from IPython.display import HTML<br>
      HTML(anim.to_html5_video())  #playback option 1<br>
      #HTML(anim.to_jshtml())       #playback option 2</p>
    <p>Played an animation for me. Initially, there is a spike at the
      center of the grid, and it evolves to become flat. (It also
      printed a deprecation warning about the "close_event" function,
      whatever that is).</p>
    <p>Did you click through to this cell or did you stop at the one
      before? Because the one before it just displays a still image.</p>
    <p>The WaveEquation also worked for me by just clicking through the
      cells in order.<br>
    </p>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CALW_x=7gcp1+h9RtwyZkaRc2iKr99htn3Yo0Lno1bYnXPCUq6Q@mail.gmail.com">
      <div dir="ltr">
        <div><br>
        </div>
        <div>I'm trying to understand how Cactus works, so I ran every
          cell in the notebook while looking at the Terminal and seeing
          how each file is created and its contents. </div>
        <div>The problem comes when I finally run the simulations, which
          take a while. </div>
      </div>
    </blockquote>
    This happens in seconds for me.<br>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CALW_x=7gcp1+h9RtwyZkaRc2iKr99htn3Yo0Lno1bYnXPCUq6Q@mail.gmail.com">
      <div dir="ltr">
        <div>So after the running is complete, there's this section
          called "Extract data from hdf5 files".</div>
        <div>The files exist, as I have previously checked, but the time
          steps array is actually a [0,0] array in the heat equation,
          and a very random array in the wave equation. </div>
        <div>In both cases, when plotting the simulations, the solution
          does not change from the initial condition.</div>
      </div>
    </blockquote>
    Did you modify the cells from the original tutorial? Because this
    all just worked for me.<br>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CALW_x=7gcp1+h9RtwyZkaRc2iKr99htn3Yo0Lno1bYnXPCUq6Q@mail.gmail.com">
      <div dir="ltr">
        <div><br>
        </div>
        <div>I tried to open the data files to see if I could understand
          what was going on but I'm unable to open these kind of files,
          and Cactus being a black box leaves me helpless to see where
          the mistake is coming from.</div>
      </div>
    </blockquote>
    <p>So I disagree that Cactus is a black box since it is open source
      and the purpose of these tutorials is to show how it works... but
      it's a very big non-black box which can be overwhelming.</p>
    <p>I think your problem is the hdf5 files, not Cactus. Hdf5 is a
      file format that Cactus uses. You can open them with commands like
      h5ls, or Python's h5py library (which the notebook provides some
      examples of usage).<br>
    </p>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CALW_x=7gcp1+h9RtwyZkaRc2iKr99htn3Yo0Lno1bYnXPCUq6Q@mail.gmail.com">
      <div dir="ltr">
        <div><br>
        </div>
        <div>I want to work on the problems at the end of these
          notebooks, but not correctly seeing the solution makes me
          think there's something wrong since the beggining, and I have
          not changed anything else from the initial notebook.</div>
      </div>
    </blockquote>
    <p>So I'm not 100% sure what's going on, but I suspect you've either
      not clicked far enough or you have modified the notebook. Please
      check and let me know.</p>
    <p>--Steve<br>
    </p>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CALW_x=7gcp1+h9RtwyZkaRc2iKr99htn3Yo0Lno1bYnXPCUq6Q@mail.gmail.com">
      <div dir="ltr">
        <div><br>
        </div>
        <div>Has this happened to anyone before?</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>I'm sorry for the long email, I'm very new to this software
          and there's so much to learn! :-)</div>
        <div>Thank you in advance.</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>- Enzo</div>
      </div>
      <br>
      <div class="gmail_quote">
        <div dir="ltr" class="gmail_attr">El mié, 8 mar 2023 a las
          14:02, Steven R. Brandt (&lt;<a
            href="mailto:sbrandt@cct.lsu.edu" moz-do-not-send="true"
            class="moz-txt-link-freetext">sbrandt@cct.lsu.edu</a>&gt;)
          escribió:<br>
        </div>
        <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px
          0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
          <div>
            <p>You've come to the right place. What's the problem?</p>
            <p>--Steve<br>
            </p>
            <div>On 3/7/2023 7:41 PM, Enzo Iubini wrote:<br>
            </div>
            <blockquote type="cite">
              <div dir="ltr">
                <div>Hello!</div>
                <div>Thank you for approving my tutorial account.</div>
                <div><br>
                </div>
                <div>I have a small question. I'm having a bit of
                  trouble with some tutorial notebooks, in particular
                  the Heat Equation and Wave Equation notebooks, where
                  the simulations are not running properly. The question
                  is, who can I contact to get support with this? I
                  would not want to bug you if this is not your job, but
                  I'm a little lost and got nobody to ask for help.</div>
                <div><br>
                </div>
                <div>Thank you in advance.</div>
                <div>Greetings!</div>
                <div><br>
                </div>
                <div>Enzo Iubini</div>
              </div>
              <br>
              <div class="gmail_quote">
                <div dir="ltr" class="gmail_attr">El lun, 5 dic 2022 a
                  las 13:12, Steven R. Brandt (&lt;<a
                    href="mailto:sbrandt@cct.lsu.edu" target="_blank"
                    moz-do-not-send="true" class="moz-txt-link-freetext">sbrandt@cct.lsu.edu</a>&gt;)
                  escribió:<br>
                </div>
                <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px
                  0px 0.8ex;border-left:1px solid
                  rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Approved. :)<br>
                  <br>
                  --Steve<br>
                  <br>
                  On 12/5/2022 9:53 AM, <a
                    href="mailto:RegistrationBot@einsteintoolkit.org"
                    target="_blank" moz-do-not-send="true"
                    class="moz-txt-link-freetext">RegistrationBot@einsteintoolkit.org</a>
                  wrote:<br>
                  &gt; Einstein Toolkit maintainers:<br>
                  &gt;<br>
                  &gt; New Tutorial Request:<br>
                  &gt; Name: <a
                    href="http://orcid.org/0000-0001-9327-0832"
                    rel="noreferrer" target="_blank"
                    moz-do-not-send="true" class="moz-txt-link-freetext">http://orcid.org/0000-0001-9327-0832</a><br>
                  &gt; Email: <a href="mailto:egic.enzo@gmail.com"
                    target="_blank" moz-do-not-send="true"
                    class="moz-txt-link-freetext">egic.enzo@gmail.com</a><br>
                  &gt; Organization: ORCID<br>
                  &gt; Why: Hello!<br>
                  &gt; My name is Enzo Iubini and I'm doing my Master's
                  degree in Applied Mathematics. I study at Universidad
                  de Chile, and my work is about binary black holes. My
                  proffessor has recommended me to try Einstein toolkit,
                  but I'm having trouble understanding how to work
                  around it, therefore I'd really like to have a
                  tutorial account.<br>
                  &gt; I do not have a homepage.<br>
                  &gt;<br>
                  &gt; Thanks in advance!<br>
                  &gt;<br>
                  &gt;<br>
                  &gt; The above user has requested a tutorial account.<br>
                  &gt;<br>
                  &gt; Thanks,<br>
                  &gt; Einstein Toolkit Registration Bot<br>
                  &gt;<br>
                  &gt; _______________________________________________<br>
                  &gt; Maintainers mailing list<br>
                  &gt; <a href="mailto:Maintainers@einsteintoolkit.org"
                    target="_blank" moz-do-not-send="true"
                    class="moz-txt-link-freetext">Maintainers@einsteintoolkit.org</a><br>
                  &gt; <a
                    href="http://lists.einsteintoolkit.org/mailman/listinfo/maintainers"
                    rel="noreferrer" target="_blank"
                    moz-do-not-send="true" class="moz-txt-link-freetext">http://lists.einsteintoolkit.org/mailman/listinfo/maintainers</a><br>
                </blockquote>
              </div>
            </blockquote>
          </div>
        </blockquote>
      </div>
    </blockquote>
  </body>
</html>