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<body dir="ltr">
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Hi all,</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
After having installed the toolkit on Leonardo, CINECA, I wanted to try the TOV examples.<br>
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
However, I am getting the following warnings:</div>
<blockquote style="margin-left: 0.8ex; padding-left: 1ex; border-left: 3px solid rgb(200, 200, 200);">
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Warning: Too many threads per process specified: specified num-threads=56 (ppn-used is 112) </div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Warning: Total number of threads and number of threads per process are inconsistent: procs=16, num-threads=56 (procs*num-smt must be an integer multiple of num-threads) </div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Warning: Total number of threads and number of cores per node are inconsistent: procs=16, ppn-used=112 (procs must be an integer multiple of ppn-used) </div>
</blockquote>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
>From those, it seems that I am doing something wrong either in my <code>machine.ini</code> file or in the resources request when submitting the job.<br>
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Here is the command I use to run the TOV example:</div>
<blockquote style="margin-left: 0.8ex; padding-left: 1ex; border-left: 3px solid rgb(200, 200, 200);">
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
./simfactory/bin/sim submit tov_ET --parfile par/tov_ET.par --cores 16 --walltime 00:20:00</div>
</blockquote>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
And here is the ini file I am using (the "Cluster characteristics" section is identical to
<a title="https://bitbucket.org/simfactory/simfactory2/commits/0d4011bf554ee695f9543e048ae9ff5edc5b5c98" class="OWAAutoLink" id="LPlnk219685" href="https://bitbucket.org/simfactory/simfactory2/commits/0d4011bf554ee695f9543e048ae9ff5edc5b5c98">
Bruno Giacomazzo's file</a>:</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<a class="OWAAutoLink" id="OWAf12d549f-1f13-e5cc-69ab-c638900155a0" href="https://github.com/piosif/einstein-toolkit-config-leonardo/blob/main/leonardo-dcgp1.ini">https://github.com/piosif/einstein-toolkit-config-leonardo/blob/main/leonardo-dcgp1.ini</a></div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
The job ran and completed fine, but from what I understand, it ran on 56 cores instead of the 16 that I requested.</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
>From what I understand, the problem is that I am requesting just 16 cores for this simple test, but due to the cluster specs in the ini file, SimFactory expects me to request a multiple of 56.</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Is that so?</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
So, my question is the following:</div>
<ul data-editing-info="{"applyListStyleFromLevel":false,"unorderedStyleType":2}" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;">
<li style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); list-style-type: "- ";">
<div role="presentation" class="elementToProof">I want to do some tests, running a single star e.g. on a single node using 16, 32, 64 cores (to understand the timescale required). Do I need to change my ini file?</div>
</li><li style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); list-style-type: "- ";">
<div role="presentation" class="elementToProof">Or is there some option to specify when submitting the job that will override the cluster specs?</div>
</li></ul>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
I read the <a title="https://simfactory.bitbucket.io/simfactory2/userguide/processterminology.html" class="OWAAutoLink" id="LPlnk297755" href="https://simfactory.bitbucket.io/simfactory2/userguide/processterminology.html">
simfactory's terminology explanation on nodes, threads etc</a>, but it is not clear to me how to request the cores I need.<br>
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">
Best,<br>
Panayotis</div>
</body>
</html>