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<body dir="ltr">

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

Hi all,<br>

<br>

I am not sure I understand what the <b>output-xxxx</b> folders do under each individual simulation folder.<br>

<br>

</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

Suppose we <b>"create-submit"</b> a new simulation named <b>test</b>.</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

The results will appear in the <b>output-0000</b> folder under the folder "home/username/simulations/test/".</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

OK, great.</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<br>

</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

Suppose now we want to re-run that simulation.</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

And suppose we want to re-run it from scratch and not continue from a previous checkpoint (e.g. maybe we forgot to save some output we needed). <br>

The skeleton is already created, so we can just use the command <b>submit</b> this time.</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

The results will appear in the <b>output-0001</b> folder.</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

Is the above understanding correct?</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<br>

</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<b>Questions:</b></div>

<ul data-editing-info="{"applyListStyleFromLevel":true}" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; list-style-type: disc;">

<li style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">

<div role="presentation" class="elementToProof">When we submit again the simulation for the re-run, do we have to specify the same computational resources?</div>

</li><ul data-editing-info="{"applyListStyleFromLevel":true}" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; list-style-type: circle;">

<li style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">

<div role="presentation" class="elementToProof">I.e. is this info something already encoded in the simulation's skeleton and therefore we should keep it fixed for consistency?</div>

</li></ul>

<li style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">

<div role="presentation" class="elementToProof">Does the skeleton of the simulation also fix what quantities are saved and therefore if we forgot to save some quantity we have to create a new simulation skeleton?</div>

</li></ul>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<br>

</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

Additionally, from what I understand, the <b>output-xxxx</b> folders mainly handle different

<b>checkpoints</b> of a larger simulation that could take weeks or months.</div>

<ul data-editing-info="{"applyListStyleFromLevel":true}" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; list-style-type: disc;">

<li style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">

<div role="presentation" class="elementToProof">Does the user have to do anything to combine all the information from the checkpoints, or is this handled automatically by ETK / SimFactory?</div>

</li><li style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">

<div role="presentation" class="elementToProof">Is there any advice on best practices regarding this scenario?</div>

</li></ul>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<br>

</div>

<div style="font-family: Aptos, "Aptos_EmbeddedFont", "Aptos_MSFontService", Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);" class="elementToProof">

<br>

Best,<br>

Panayotis<br>

<br>

<br>

<span style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; color: rgb(153, 153, 153);">-------------------</span></div>

<div id="Signature">

<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(153, 153, 153);">

Panagiotis Iosif</div>

<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(153, 153, 153);">

postdoctoral researcher</div>

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Department of Physics, University of Trieste </div>

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Via Alfonso Valerio 2, Trieste 34127</div>

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Italy</div>

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-------------------</div>

<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">

<br>

</div>

</div>

</body>

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